banner
Дом / Новости / CYP4F12 является потенциальным биомаркером и ингибирует миграцию клеток плоскоклеточного рака головы и шеи по пути ЕМТ.
Новости

CYP4F12 является потенциальным биомаркером и ингибирует миграцию клеток плоскоклеточного рака головы и шеи по пути ЕМТ.

Aug 12, 2023Aug 12, 2023

Научные отчеты, том 13, Номер статьи: 10956 (2023) Цитировать эту статью

331 Доступов

Подробности о метриках

Плоскоклеточный рак головы и шеи (ПГНШ) — наиболее распространенная злокачественная опухоль головы и шеи. Из-за коварной природы HNSC и отсутствия эффективных индикаторов ранней диагностики разработка новых биомаркеров для улучшения прогноза пациентов становится особенно актуальной. В этом исследовании мы изучили и подтвердили корреляцию между уровнями экспрессии члена 12 подсемейства F цитохрома P450 семейства 4 (CYP4F12) и прогрессированием HNSC, используя данные из Атласа генома рака (TCGA), наборов данных Gene Expression Omnibus (GEO) и собранных образцов пациентов. Мы проанализировали связь экспрессии CYP4F12 с клинико-патологическими особенностями, иммунной корреляцией и прогнозом. Наконец, мы проанализировали корреляцию между CYP4F12 и путями и подтвердили экспериментами. Результаты показали, что CYP4F12 мало экспрессируется в опухолевых тканях, участвует в различных фенотипических изменениях HNSC и влияет на инфильтрацию иммунных клеток. Анализ путей показал, что CYP4F12 может играть ключевую роль в миграции и апоптозе опухолевых клеток. Экспериментальные результаты показали, что сверхэкспрессия CYP4F12 ингибирует миграцию клеток и усиливает адгезию между клетками и матриксом за счет ингибирования пути эпителиально-мезенхимального перехода (EMT) в клетках HNSC. В заключение, наше исследование дало представление о роли CYP4F12 в HNSC и показало, что CYP4F12 может быть потенциальной терапевтической мишенью для HNSC.

HNSC, на долю которого приходится 90% всех случаев рака головы и шеи, является шестым наиболее распространенным типом рака в мире1,2. HNSC развивается в слизистых оболочках носовой, ротовой, гортарингеальной и гортанной полостей3,4. HNSC обычно связан с воздействием канцерогенов, вызываемых табаком, чрезмерным употреблением алкоголя и инфекцией вируса папилломы человека (ВПЧ)5,6. Хотя методы лечения улучшились за последние сорок лет, общие показатели выживаемости существенно не изменились7,8. Поэтому крайне важно продолжить изучение патогенеза HNSC и разработать прогностические биомаркеры для улучшения выявления и выживаемости пациентов с HNSC.

Суперсемейство цитохрома P450 человека (CYP450) представляет собой полигенное семейство ферментов, состоящее из 18 семейств, которые экспрессируются во многих тканях9,10. Ферменты CYP450 участвуют в окислительном метаболизме различных эндогенных соединений (таких как липиды и стероиды) и экзогенных соединений (таких как лекарства и токсины)11,12. Недавно в литературе было показано, что эти ферменты также могут играть важную роль в онкогенезе13,14,15. Они могут непосредственно участвовать в инициировании и прогрессировании опухоли16,17 или участвовать в опухолевом процессе через некоторые метаболиты18,19,20 или влиять на лечение опухоли путем метаболизма химиотерапевтических препаратов21,22. Растущее количество литературы предполагает, что члены семейства CYP450 играют решающую роль в прогрессировании рака. Однако роль и механизмы CYP4F12 при HNSC остаются неясными.

В этом исследовании мы изучили экспрессию CYP4F12 в различных типах опухолей, изучили его скрытую роль в иммунной инфильтрации HNSC и оценили его прогностическую ценность у пациентов с HNSC. Кроме того, мы исследовали молекулярные изменения и иммунные характеристики HNSC и оценили их влияние на клинические результаты. Далее мы проанализировали дифференциально экспрессируемые гены и функциональное обогащение, связанное с экспрессией CYP4F12. Наконец, мы провели эксперименты in vitro, чтобы определить ингибирующее действие CYP4F12 на миграцию и адгезию клеток HNSC, и исследовали потенциальный основной механизм. Целью настоящего исследования было подтвердить, может ли CYP4F12 быть многообещающим прогностическим биомаркером для прогноза HNSC и ответа на иммунотерапию.

Экспрессию CYP4F12 в различных линиях раковых клеток и специфических клеточных линиях HNSC анализировали с использованием набора данных Энциклопедии раковых клеточных линий (CCLE) (https://portals.broadinstitute.org/ccle/about) с помощью R V4.0.3. программное обеспечение (https://www.r-project.org/) пакет GGplot2 (v3.3.3)23.

 1 or log2 (fold change) < − 1″ were defined as thresholds for mRNA differential expression screening. Data were analyzed by feature enrichment to confirm the potential functions of potential targets, using ClusterProfiler (v4.2.2) package31 in R to analyze the Gene Ontology (GO) function of potential mRNAs and enrich the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway31./p> 0.05) in terms of gender, pathological stage, tumor grade, smoking, alcohol history, radiationtherapy, lymphovascular invasion, and new tumor event type. These results suggest that the expression level of CYP4F12 may be associated with certain phenotypes of HNSC./p>